#?-*-?coding:?utf-8?-*-

import?time
import?os
import?math
import?argparse
from?glob?import?glob
from?collections?import?OrderedDict
import?random
import?warnings
from?datetime?import?datetime

import?numpy?as?np
from?tqdm?import?tqdm

from?sklearn.model_selection?import?train_test_split
from?skimage.io?import?imread?imsave

import?torch
import?torch.nn?as?nn
import?torch.nn.functional?as?F
from?torch.autograd?import?Variable
import?torch.optim?as?optim
from?torch.optim?import?lr_scheduler
from?torch.utils.data?import?DataLoader
import?torch.backends.cudnn?as?cudnn
import?torchvision
from?torchvision?import?datasets?models?transforms

from?dataset?import?Dataset

import?Unet
from?metrics?import?dice_coef?batch_iou?mean_iou?iou_score?ppvsensitivity
import?losses
from?utils?import?str2bool?count_params
from?sklearn.externals?import?joblib
#from?hausdorff?import?hausdorff_distance
import?imageio
#import?ttach?as?tta
import?SimpleITK?as?sitk

wt_dices?=?[]
tc_dices?=?[]
et_dices?=?[]
wt_sensitivities?=?[]
tc_sensitivities?=?[]
et_sensitivities?=?[]
wt_ppvs?=?[]
tc_ppvs?=?[]
et_ppvs?=?[]
wt_Hausdorf?=?[]
tc_Hausdorf?=?[]
et_Hausdorf?=?[]


def?hausdorff_distance（lTlP）:
????labelPred=sitk.GetImageFromArray（lP?isVector=False）
????labelTrue=sitk.GetImageFromArray（lT?isVector=False）
????hausdorffcomputer=sitk.HausdorffDistanceImageFilter（）
????hausdorffcomputer.Execute（labelTrue>0.5labelPred>0.5）
????return?hausdorffcomputer.GetAverageHausdorffDistance（）#hausdorffcomputer.GetHausdorffDistance（）

def?CalculateWTTCET（wtpbregionwtmaskregiontcpbregiontcmaskregionetpbregionetmaskregion）:
????#開始計(jì)算WT
????dice?=?dice_coef（wtpbregionwtmaskregion）
????wt_dices.append（dice）
????ppv_n?=?ppv（wtpbregion?wtmaskregion）
????wt_ppvs.append（ppv_n）
????Hausdorff?=?hausdorff_distance（wtmaskregion?wtpbregion）
????wt_Hausdorf.append（Hausdorff）
????sensitivity_n?=?sensitivity（wtpbregion?wtmaskregion）
????wt_sensitivities.append（sensitivity_n）
????#?開始計(jì)算TC
????dice?=?dice_coef（tcpbregion?tcmaskregion）
????tc_dices.append（dice）
????ppv_n?=?ppv（tcpbregion?tcmaskregion）
????tc_ppvs.append（ppv_n）
????Hausdorff?=?hausdorff_distance（tcmaskregion?tcpbregion）
????tc_Hausdorf.append（Hausdorff）
????sensitivity_n?=?sensitivity（tcpbregion?tcmaskregion）
????tc_sensitivities.append（sensitivity_n）
????#?開始計(jì)算ET
????dice?=?dice_coef（etpbregion?etmaskregion）
????et_dices.append（dice）
????ppv_n?=?ppv（etpbregion?etmaskregion）
????et_ppvs.append（ppv_n）
????Hausdorff?=?hausdorff_distance（etmaskregion?etpbregion）
????et_Hausdorf.append（Hausdorff）
????sensitivity_n?=?sensitivity（etpbregion?etmaskregion）
????et_sensitivities.append（sensitivity_n）


def?parse_args（）:
????parser?=?argparse.ArgumentParser（）

????parser.add_argument（‘--name‘?default=None
????????????????????????help=‘model?name‘）
????parser.add_argument（‘--mode‘?default=None
????????????????????????help=‘‘）