第一部分介紹了計算機輔助藥物設(shè)計的發(fā)展概況與計算 機輔助藥物分子設(shè)計有關(guān)的統(tǒng)計和理論計算方法，包括數(shù)值和非數(shù)值優(yōu)化方法、 分子力學(xué)方法、分子動力學(xué)方法、構(gòu)象分析方法、溶劑效應(yīng)以及自由能計算方 法;第二部分介紹了計算機輔助藥物分子設(shè)計中的主要方法，包括構(gòu)效關(guān)系方 法、藥效團模型方法、從頭設(shè)計方法、分子對接方法、數(shù)據(jù)庫搜索方法、藥代 動力學(xué)以及毒性的預(yù)測方法;第三部分則選擇了兩個具體的實例，介紹了計算 機輔助藥物分子設(shè)計方法在藥物先導(dǎo)化合物發(fā)現(xiàn)和優(yōu)化方面的應(yīng)用。附錄一和 附錄二則簡要介紹了 CADD 方法中幾個常用的概念及列出了 CADD 中常用的軟 件和程序。在介紹 CADD 方法和應(yīng)用的基礎(chǔ)上，本書還用了大量篇幅介紹 CADD中涉及的相關(guān)理論和計算方法，這部分內(nèi)容涉及了較多的線性代數(shù)、高 等數(shù)學(xué)、分析力學(xué)、統(tǒng)計力學(xué)以及量子力學(xué)等學(xué)科的相關(guān)內(nèi)容。這些理論計算 方法在CADD中應(yīng)用非常廣泛或是某些CADD方法的重要組成部分，對其系統(tǒng) 的了解可以幫助讀者更加深入地理解后續(xù)章節(jié)中介紹的 CADD 方法。當然，這 幾章的內(nèi)容也具有相對的獨立性，讀者完全可以跳過這部分內(nèi)容而直接閱讀 CADD方法和應(yīng)用的相關(guān)章節(jié)。本書沒有單獨分出章節(jié)介紹量子化學(xué)方法，主 要原因是這部分涉及的內(nèi)容非常廣泛，在很小的篇幅內(nèi)很難對其做出系統(tǒng)及有 效的闡述，此外，國內(nèi)外關(guān)于這方面的專著也很多，有需要的作者可以參考有 關(guān)的著作。本書力求介紹 CADD 方法研究和應(yīng)用領(lǐng)域的最新進展，但 CADD 是 國際上非?；钴S的研究領(lǐng)域，發(fā)展速度很快，涉及的內(nèi)容非常廣泛，加上作者 學(xué)識有限，在寫作的過程難免有遺漏和錯誤，懇請讀者批評和指正。 本書的第一章由徐筱杰教授執(zhí)筆，第二章~第三章由喬學(xué)斌博士執(zhí)筆，第 四章由侯廷軍博士和章威執(zhí)筆，第五章~第六章由章威和侯廷軍博士執(zhí)筆，第 七章~第十三章由侯廷軍博士執(zhí)筆，第十四章由侯廷軍博士和喬學(xué)斌博士執(zhí)筆， 第十五章~第十六章由侯廷軍博士執(zhí)筆，附錄由侯廷軍博士、喬學(xué)斌博士和章 威共同完成。最后全書由徐筱杰教授和侯廷軍博士修改定稿。 本書是徐筱杰教授課題組多年研究工作的結(jié)晶，是組里一屆又一屆本科生、 研究生研究工作的經(jīng)驗總結(jié)和積累。多年來我們的工作得到國內(nèi)同行們的許多 支持與幫助，也得到養(yǎng)生堂藥業(yè)有限公司、創(chuàng)騰科技有限公司及凱鵬公司的大 力支持與幫助。作者特向他們致以衷心的感謝。書中引用了大量國內(nèi)外同行發(fā) 表的一些寶貴資料，在此一并致謝。